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Meu painel e análise da dinâmica da propagação da infecção por COVID-19



Quero compartilhar meu painel e análise da dinâmica da propagação da infecção. O painel está escrito no Planilhas Google e no Script do Google Apps.

Minuto de Cuidados com OVNI


COVID-19 — , SARS-CoV-2 (2019-nCoV). — , /, .



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Nota: O autor não afirma ser dados objetivos. Existem muitos fatores diretos e indiretos que afetam a confiabilidade das estatísticas atuais. No final da pandemia, serão realizadas pesquisas e meta-análises profissionais que permitirão uma avaliação objetiva da pandemia em números. Este artigo foi publicado para nos familiarizar com uma ferramenta para analisar a dinâmica da propagação da infecção com base nos dados publicados pela OMS em seus relatórios.

Os painéis estão disponíveis neste endereço . Os dados são atualizados automaticamente diariamente, à medida que os relatórios da OMS são publicados. O conteúdo não se adapta a dispositivos móveis. Melhor assistir na tela grande.

Pelo que


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  • É conveniente abrir o laptop de manhã e em uma tela para descobrir o que aconteceu no dia anterior.
  • Esta é uma ótima oportunidade para praticar com o Planilhas Google e o Script do Google Apps.


Dados


Inicialmente, usei os dados dos relatórios da OMS , mas eles cometeram erros ao transferir dados dos relatórios para o banco de dados ou alteraram o tempo em que consideravam novos casos de infecção. Como resultado, reescrevi scripts para usar dados do ECDC . Esses são os mesmos dados da OMS, mas com um tempo de publicação estável e sem erros.

O que olhar




  • Informadores. Eles exibem a dinâmica chave atual em todo o mundo;
  • A dinâmica do número total de casos de infecção no mundo (TOTAL DE CASOS);
  • A dinâmica de novas infecções em todo o mundo (DAILY NEW CASES);
  • A dinâmica da propagação de infecções e mortes por país;
  • Avalie visualmente a situação no mapa do mundo;
  • Dinâmica da mortalidade (CFR);
  • A duração do período de pico da epidemia por país;
  • Correlação do amplo índice S&P 500 com o número de novas infecções;
  • Descubra o quão crítica é a situação em um país específico, ajustada para a população desse país.


Mortalidade (CFR)




Há muito debate na Internet sobre a letalidade do novo coronavírus, há artigos sobre Habré. Não quero entrar em outra controvérsia, apenas opero os dados que temos.

Sim, definitivamente existem problemas na coleta de estatísticas, há problemas nos testes em massa, o que tornaria possível julgar com mais precisão a mortalidade. A precisão dos dados também é afetada por fatores como a epidemia de gripe sazonal na Europa, alta mortalidade em geral em alguns países, como a Índia, que, possivelmente combinada com problemas de infraestrutura de saúde, simplesmente erode as estatísticas de mortalidade do novo coronavírus. Admito que em países com um grande número de infecções, devido à carga no sistema de saúde, é simplesmente impossível determinar a causa da morte em tempo hábil ou, pelo contrário, atribuí-la a um novo vírus. Mas, você pode definitivamente dizer com certeza que muitos subestimaram a criticidade da situação.

As pessoas confundem mortalidade com mortalidade . De acordo com quem e Taxa de mortalidade do CDC para influenza sazonal - 0,1% , para coronavírus SARS-CoV-2 - 4,45% no momento da redação deste documento (26.03.2020). Em alguns países, como a Itália, a mortalidade chega a 9% no momento.

Sim, a letalidade do novo coronavírus não é tão alta quanto a do MERS-CoV e Ebola (34% e 50%), mas a contagiosidade , virulência , velocidade e extensão da propagação do novo coronavírus não podem ser comparadas - elas são muito maiores.

Horário de pico


Para trabalhar, eu precisava saber quanto tempo dura o período de pico da epidemia em um país específico. Se considerarmos que a maioria dos países adotará medidas mais ou menos proporcionais da quarentena total, com base na experiência de outros países, será possível julgar quando a epidemia diminuirá em um determinado país.

Não encontrei nenhuma metodologia para determinar o período de pico, então tive que improvisar. Com base na dinâmica do número de novas infecções, decidi determinar a importância de novas infecções, com base nas quais seria possível julgar se o pico da epidemia passou ou se o país está em um período de pico. Como a média e a mediana não se encaixavam, decidi usar o Quartile. Retirei dias com valor zero de uma amostra de dados sobre novas infecções; após essa normalização, usei a função de determinar o valor do Terceiro Quartil. Além disso, a fórmula considera o número de dias que excedem o valor do terceiro quartil - essa é a duração do período de pico.

Se você aplicar esse cálculo a todos os países, ele poderá ser usado para comparar o período de pico dos países.

O período de pico refletirá de maneira mais confiável a situação no final da epidemia. Você pode ver os cronogramas da China e da Coréia do Sul, onde o pico da epidemia já passou. Apesar do fato de novas infecções ainda estarem presentes na China e na Coréia do Sul, o cálculo do período de pico reflete perfeitamente a eficácia dos métodos notórios de métodos de quarentena total e suavização de curvas adotados na Coréia do Sul. Lembre-se de que existe o risco de uma segunda onda da epidemia no sul da Ásia. Devido à remoção apressada da quarentena ou à importação do vírus de países vizinhos, onde a epidemia está apenas começando. Portanto, o período de pico pode aumentar.

Tabela Resumo do País


Ele exibe todas as informações principais por país e também existem cronogramas pelos quais você pode avaliar visualmente a curva epidêmica.



Dados do mapa mundial


A visualização no mapa permite avaliar os focos atuais de infecção.



O que pretendo adicionar


  • Tabelas separadas sobre o número de infecções ajustadas para a população ;
  • Visualização de dinâmica em mapas mundiais ajustados para população ;
  • Destaque visualmente os períodos de pico se uma epidemia em um país em particular estiver atualmente em um período de pico.


Comentários


Ficarei feliz em ouvir seus desejos e recomendações para tornar o Painel ainda mais informativo.

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