Por que (possivelmente) superestimamos a letalidade do COVID-19

! Atenção, eu não sou médico, minha opinião pessoal é afirmada aqui. Este post NÃO tem como objetivo avaliar seus riscos e tomar decisões sobre sua saúde!

Agora, quando todos os países do mundo adotam medidas proibitivas de uma maneira ou de outra, o mais importante é a avaliação correta da mortalidade da doença. Infelizmente, quase nenhuma atenção é dada a isso, no entanto, é esse fator que deve determinar o escopo das medidas proibitivas. A disseminação descontrolada de quarentena pode paralisar completamente a economia global (que já estamos observando) e piorar a qualidade de vida e os investimentos em saúde das pessoas em todo o planeta. Existe uma crença generalizada de que os diagnósticos por PCR nos mostram a imagem exata, mas não é assim. O diagnóstico de PCR é apenas uma ferramenta com suas limitações. Se a amostra errada da população for adicionada a isso, veremos “clima em Marte” em vez de pelo menos uma estimativa razoável.

Minuto de Cuidados com OVNI


A pandemia de COVID-19, uma infecção respiratória aguda potencialmente grave causada pelo coronavírus SARS-CoV-2 (2019-nCoV), foi anunciada oficialmente no mundo. Há muitas informações sobre Habré sobre esse tópico - lembre-se sempre de que pode ser confiável / útil e vice-versa.

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Fontes oficiais

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Eu não faço química bio-orgânica agora, todas as conclusões são baseadas em um curso universitário e discussões com biólogos e pessoas envolvidas, inclusive em diagnóstico molecular. Se alguém tiver informações mais precisas sobre a sensibilidade e a especificidade dos testes, eu posso adicioná-las ao artigo.

Qualquer teste binário está sujeito a resultados falso-positivos e falso-negativos. Se o teste for falso positivo: diagnosticamos uma pessoa com COVID, mas ela realmente não é. Se o teste for falso negativo: a pessoa tem um COVID, mas não o diagnosticamos. A rigor, a PCR em tempo real não é um teste binário e pode até determinar a concentração de um vírus, mas sua interpretação para COVID, tanto quanto eu sei, agora é binária (detectada / não detectada).

Agora vamos considerar em que estágios os erros podem ocorrer.

O diagnóstico de PCR inclui vários estágios.

  • amostragem
  • transportando a amostra para o amplificador
  • transcrição reversa (temos um vírus RNA e produzimos DNA por PCR)
  • PCR em tempo real

A PCR em tempo real sozinha é um método muito preciso para determinar a presença de DNA do vírus. No entanto, é importante que o DNA do vírus esteja presente! Se a amostra não for selecionada corretamente ou a concentração de vírus estiver abaixo do limite de detecção do método, o teste produzirá um resultado falso negativo. Além disso, a amostra pode ser destruída antes mesmo de entrar no amplificador, o que também levará a um resultado falso-negativo. Um problema especial é a transcrição reversa; se for feita incorretamente, simplesmente não haverá nada para amplificar. Foi nessa parte que houve sérias questões para o teste Vector. Além disso, erros podem ser cometidos no processo de introdução de reagentes de PCR (teoricamente, há um controle positivo e negativo, mas você pode até mexer com ele). Ou seja, para obter um resultado verdadeiramente positivo, é necessário queAs estrelas concordaram que todos os pontos do programa foram executados corretamente.

Vamos agora considerar em que casos podemos obter um resultado falso-positivo. Existem várias opções:

  • contaminação da amostra
  • amplificação não específica
  • erro técnico ao configurar o dispositivo

Com a contaminação da amostra, tudo fica claro, é necessário trabalhar com cuidado. Mais difícil com a amplificação inespecífica, pode ser causada, por exemplo, pelo design inadequado do primer ou pela limpeza deficiente dos primers / reagentes. Do meu ponto de vista, a probabilidade disso não é muito alta: a seleção de primers é uma tarefa puramente bioinformática que, em teoria, pode ser realizada uma vez no nível da OMS (embora teoricamente se possa presumir que diferentes coronavírus "andem" em diferentes regiões do mundo e alguns possam dar teste positivo). A síntese e purificação de primers é uma operação tecnológica estabelecida há muito tempo e também não deve haver problemas com sua qualidade.

No entanto, vários testes, incluindo os testes Vector e CDC, foram criticados pela alta parcela de resultados falso-positivos. No entanto, isso dizia respeito aos próprios testes e não a todo o procedimento, incluindo a seleção dos testes, a entrega da amostra.

Do meu ponto de vista pessoal, pelas razões expostas acima, agora há uma maior probabilidade de receber resultados falsos negativos. Nesse caso, isso leva a consequências muito tristes.

O que acontece se uma pessoa facilmente doente (da qual a grande maioria) tem um resultado falso negativo? Ele se alegra e vai para casa. Os recursos do sistema são limitados e, nesse caso, ninguém testará uma segunda vez. Ao mesmo tempo, uma pessoa é removida das estatísticas dos pacientes, aumentando a mortalidade observada (vemos apenas casos graves). Mesmo se ele ainda estiver doente, a companhia de seguros simplesmente não permitirá que ele faça um segundo teste até que a situação exija hospitalização. Além disso, se uma pessoa chegar em estado grave e o primeiro teste for negativo, provavelmente ele será submetido a um segundo teste, aumentando assim a precisão geral do diagnóstico. No caso de um teste falso positivo, é provável que uma pessoa seja submetida a todo o complexo de medidas de diagnóstico, faça outro teste, faça TC, etc.E ele tem a chance de sair das estatísticas com o comentário "O diagnóstico não foi confirmado".

Assim, o modelo acima do processo (e este é precisamente o modelo, preste atenção), leva à exclusão das estatísticas de pacientes facilmente enfermos! no caso de diagnóstico avançado de PCR.

Mas a situação é ainda mais interessante, a maioria dos casos de COVID desaparece com sintomas que não requerem a atenção de um médico. As pessoas podem simplesmente não procurar ajuda e isso também contribui para uma diminuição na taxa de mortalidade observada. Isso foi especialmente verdadeiro há um ou dois meses, quando a epidemia não alcançou proporções como agora e a epidemia, presumivelmente, estava ganhando força.

O exemplo mais característico de uma abordagem muito estranha para testar e manter estatísticas nos foi mostrado pela Itália. A quase completa ausência de testes para pacientes facilmente doentes, além de testes de todos os mortos com registro nas estatísticas de mortalidade por coronavírus, todos que foram diagnosticados com um diagnóstico positivo (eu me pergunto se a pessoa foi atropelada por um carro e ele tem um coronavírus?) - essa é a mesma “mistura explosiva” que leva a um enorme exagero. taxa de aproximação da mortalidade. A abordagem oposta nos é mostrada pela Coréia do Sul e pela Alemanha. Nesses países, é possível (!) Manter registros de pacientes facilmente doentes, o que imediatamente leva a uma diminuição das taxas de mortalidade em quase uma ordem de magnitude. Mas, nesses países, não são contabilizadas as pessoas facilmente doentes, o que deve dar uma contribuição adicional à redução da mortalidade.

Portanto, devemos obter uma avaliação mais precisa da mortalidade o mais cedo possível, porque o estado da economia depende criticamente dela (acho que todo mundo já sentiu isso).

Isso pode ser feito com a implantação de testes acelerados de anticorpos IgG, e acredito que o desenvolvimento de um teste IgG deve ser uma alta prioridade agora. Sabendo disso, seremos capazes de estimar a verdadeira mortalidade com muito mais precisão (exatamente, apenas no final da epidemia).

É claro que um dia isso será feito e tenho certeza de que teremos muitas surpresas. Na opinião pessoal do autor, até as estimativas para a Alemanha e a Coréia do Sul são muito altas. No caso mais ideal, a mortalidade pode ser ainda menor do que o vírus da gripe sazonal grave (improvável, mas possível). Essa estimativa é para países desenvolvidos, mas com um sistema honesto de contagem de mortes.

! Atenção, as estimativas aqui apresentadas são a opinião pessoal do autor e não se baseiam em nenhuma base teórica confirmada. Para a tomada de decisão, use apenas as recomendações oficiais da OMS, Rospotrebnadzor, CDC ou os serviços do seu país de residência! Lembro que, de acordo com a OMS, a taxa de mortalidade do COVID-19 é de 3,4%

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