Get best of the week

Dasbor dan analisis saya tentang dinamika penyebaran infeksi COVID-19



Saya ingin berbagi dasbor dan analisis dinamika penyebaran infeksi. Dasbor ditulis dalam Google Sheets dan Google Apps Script.

Menit Perawatan UFO


COVID-19 — , SARS-CoV-2 (2019-nCoV). — , /, .



, .

, , .

: |

Catatan: Penulis tidak mengklaim sebagai data objektif. Ada banyak faktor langsung dan tidak langsung yang mempengaruhi keandalan statistik saat ini. Pada akhir Pandemi, penelitian profesional dan meta-analisis akan dilakukan yang akan memungkinkan penilaian objektif Pandemi dalam jumlah. Artikel ini diterbitkan untuk membiasakan diri dengan alat untuk menganalisis dinamika penyebaran infeksi berdasarkan data yang diterbitkan oleh WHO dalam laporannya.

Dasbor tersedia di alamat ini . Data secara otomatis diperbarui setiap hari ketika laporan WHO dipublikasikan. Konten tidak beradaptasi untuk perangkat seluler. Lebih baik tonton di layar lebar.

Untuk apa


  • , , . , COVID-19;
  • . , . , , . ;
  • , , , ;
  • Lebih mudah untuk membuka laptop di pagi hari dan di satu layar untuk mencari tahu apa yang terjadi pada hari sebelumnya.
  • Ini adalah peluang bagus untuk berlatih dengan Google Sheets dan Google Apps Script.


Data


Awalnya, saya menggunakan data dari laporan WHO , tetapi mereka melakukan kesalahan saat mentransfer data dari laporan ke database, atau mengubah waktu relatif yang mereka anggap kasus infeksi baru. Sebagai hasilnya, saya menulis ulang skrip untuk menggunakan data dari ECDC . Ini adalah data WHO yang sama, tetapi dengan waktu publikasi yang stabil dan tidak ada kesalahan.

Apa yang harus dilihat




  • Informan. Mereka menampilkan dinamika kunci saat ini di seluruh dunia;
  • Dinamika jumlah total kasus infeksi di dunia (TOTAL CASES);
  • Dinamika infeksi baru di seluruh dunia (KASUS BARU SETIAP HARI);
  • Dinamika penyebaran infeksi dan kematian menurut negara;
  • Nilai situasi secara visual pada peta dunia;
  • Dinamika mortalitas (CFR);
  • Durasi periode puncak epidemi menurut negara;
  • Korelasi indeks S&P 500 yang luas dengan jumlah infeksi baru;
  • Cari tahu seberapa kritis situasi di negara tertentu, disesuaikan dengan populasi negara itu.


Mortalitas (CFR)




Ada banyak perdebatan di Internet tentang kematian virus corona baru, ada artikel tentang Habré. Saya tidak ingin masuk ke dalam kontroversi lain, saya hanya beroperasi pada data yang kami miliki.

Ya, pasti ada masalah dengan pengumpulan statistik, ada masalah dalam pengujian massal, yang akan memungkinkan untuk menilai kematian secara lebih akurat. Keakuratan data juga dipengaruhi oleh hal-hal seperti epidemi influenza musiman di Eropa, tingkat kematian yang tinggi secara umum di beberapa negara, seperti India, yang, mungkin dikombinasikan dengan masalah infrastruktur kesehatan, hanya mengikis statistik kematian dari virus corona baru. Saya akui bahwa di negara-negara dengan sejumlah besar infeksi, karena beban pada sistem perawatan kesehatan, sangat tidak mungkin untuk menentukan penyebab kematian pada waktu yang tepat atau, sebaliknya, menganggapnya sebagai virus baru. Tapi, Anda pasti bisa mengatakan dengan pasti bahwa banyak yang meremehkan kekritisan situasi.

Orang mengacaukan kematian dengan kematian . Menurut siapa dan Tingkat kematian CDC untuk influenza musiman - 0,1% , untuk coronavirus SARS-CoV-2 - 4,45% pada saat penulisan (26.03.2020). Di beberapa negara, seperti Italia, angka kematian mencapai 9% saat ini.

Ya, tingkat kematian dari coronavirus baru tidak setinggi MERS-CoV dan Ebola (34% dan 50%), tetapi penularan , virulensi , kecepatan dan tingkat penyebaran virus corona baru tidak dapat dibandingkan - mereka jauh lebih tinggi.

Periode puncak


Agar berhasil, saya perlu tahu berapa lama periode puncak epidemi di negara tertentu berlangsung. Jika kita memperhitungkan bahwa sebagian besar negara akan mengambil tindakan karantina total secara proporsional kurang lebih, maka berdasarkan pengalaman negara lain, kita dapat menilai kapan epidemi akan menurun di negara tertentu.

Saya tidak menemukan metodologi untuk menentukan periode puncak, jadi saya harus berimprovisasi. Berdasarkan dinamika jumlah infeksi baru, saya memutuskan untuk menentukan pentingnya infeksi baru, dengan dasar yang memungkinkan untuk menilai apakah puncak epidemi telah berlalu atau jika negara ini sedang dalam periode puncak. Rata-rata dan median tidak cocok, jadi saya memutuskan untuk menggunakan Kuartil. Saya menghapus hari dengan nilai nol dari sampel data pada infeksi baru, setelah normalisasi ini, saya menggunakan fungsi untuk menentukan nilai Kuartil Ketiga. Selanjutnya, rumus mempertimbangkan jumlah hari yang melebihi nilai Kuartil Ketiga - ini adalah durasi periode puncak.

Jika Anda menerapkan perhitungan ini untuk semua negara, maka dapat digunakan untuk membandingkan periode puncak untuk negara.

Periode puncak akan lebih andal mencerminkan situasi menjelang akhir epidemi. Anda dapat melihat garis waktu Cina dan Korea Selatan, di mana puncak puncak epidemi telah berlalu. Terlepas dari kenyataan bahwa infeksi baru masih ada di Cina dan Korea Selatan, perhitungan periode puncak dengan sempurna mencerminkan keefektifan metode terkenal dari metode karantina total dan kurva perataan yang diadopsi di Korea Selatan. Ingatlah bahwa ada risiko gelombang epidemi kedua di Asia Selatan. Karena penghapusan karantina yang tergesa-gesa, atau karena impor virus dari negara-negara tetangga, di mana epidemi baru saja dimulai. Oleh karena itu, periode puncak dapat meningkat.

Tabel Ringkasan Negara


Ini menampilkan semua informasi utama menurut negara, dan ada juga jadwal yang dengannya Anda dapat menilai kurva epidemi secara visual.



Data Peta Dunia


Visualisasi pada peta memungkinkan Anda untuk mengevaluasi fokus infeksi saat ini.



Apa yang ingin saya tambahkan


  • Pisahkan tabel pada jumlah infeksi yang disesuaikan untuk populasi ;
  • Visualisasi dinamika pada peta dunia yang disesuaikan dengan populasi ;
  • Sorot periode puncak secara visual jika epidemi di negara tertentu saat ini sedang dalam periode puncak.


Umpan balik


Saya akan senang mendengar keinginan dan rekomendasi Anda untuk membuat Dashboard lebih informatif.

More articles:


All Articles