Get best of the week

Coronavirus: filogeni, merokok, kematian, dan mengurangi risiko sakit



Ada perasaan bahwa tentang epidemi COVID-19 sekarang disiarkan dari setiap zat besi. Dalam hal ini, Habr senang dengan posting yang baik dengan sumber normal dan diskusi konstruktif. Saya juga memutuskan untuk membagikan pracetak baru tentang ekspresi ACE2 pada tikus yang dihisap, fitur genetika dan evolusi virus, serta rekomendasi untuk mengurangi risiko sakit. Dan karena kami melakukan perawatan mata di laboratorium, saya hanya punya pertanyaan yang membantu. Singkatnya - paket di kepala paling membantu.

Menit Perawatan UFO


Pandemi COVID-19, infeksi pernafasan akut yang berpotensi parah yang disebabkan oleh coronavirus SARS-CoV-2 (2019-nCoV), telah secara resmi diumumkan di dunia. Ada banyak informasi tentang Habré tentang topik ini - selalu ingat bahwa Habré dapat diandalkan / bermanfaat, dan sebaliknya.



, .

, , .

: |

Evolution complete!


Semua populasi organisme hidup berevolusi. Tidak terlalu hidup baik, jika ada tekanan seleksi alam dan kemampuan untuk bermutasi. Virus secara tradisional menempati semacam relung antara antara hidup dan tidak hidup karena sifat primitif dan ketidakmampuan mereka untuk bereproduksi secara mandiri. Sebenarnya, ini adalah bentuk kehidupan yang sangat minimalis (walaupun mereka memperdebatkannya), yang telah menyelamatkan segalanya daripada yang mungkin terjadi. Tidak ada sintesis protein, tidak ada replikasi otonom dari informasi genetik. Hanya sejumlah kecil protein pelindung, mekanisme protein untuk penetrasi ke dalam sel inang dan beberapa DNA / RNA.

Plus, virus memiliki fitur penting lain yang memungkinkan mereka untuk berevolusi urutan besarnya lebih cepat dari spesies lain. Semuanya buruk dengan mekanisme perbaikan, yang dapat dibandingkan dengan sistem kontrol paritas di TI. Oleh karena itu, mereka paling sering sama sekali tidak terkesan jika beberapa potongan kode yang tidak terlalu penting jatuh selama proses reproduksi atau, sebaliknya, fragmen DNA host ditangkap. Virus berlipat ganda dalam jumlah tertentu sehingga persentase virion yang rusak biasanya tidak memengaruhi kemampuan reproduksi.

Harus dikatakan bahwa ketidakstabilan struktur genetik ini memiliki pro dan kontra bagi kita. Di satu sisi, itu meningkatkan risiko menghindari kekebalan kita, yang, dengan mencari limfosit B, mengambil kombinasi antibodi yang berhasil untuk menekan varian virus di masa lalu. Oleh karena itu, perubahan neuraminidase dan hemagglutinin, yang HxNy dalam penunjukan strain influenza, membuat antibodi masa lalu tidak berguna. Di sisi lain, sering mutasi dalam kombinasi dengan tindakan karantina menyebabkan pemilihan strain dalam bentuk yang lebih ringan.

Sebagai contoh, jika virus 24 jam setelah infeksi menyebabkan darah mengalir dari telinga dan memiliki tingkat kematian yang tinggi, maka kemungkinan besar virus tersebut tidak dapat bereproduksi dengan cepat karena visibilitasnya, pekerjaan dokter karantina dan orang-orang kasar dengan penyembur api. Pada saat yang sama, mutan, yang alih-alih gejala yang menakutkan terbatas pada ingus terus menerus dan bersin, memiliki peluang reproduksi yang jauh lebih besar, karena mereka tidak akan mencoba untuk menutup orang-orang seperti itu ke zona karantina yang dilindungi.

Dalam kasus COVID-19, dokter berusaha untuk menangkap segala bentuk yang terlihat secepat mungkin, termasuk untuk seleksi ke arah penyakit ringan. Jika Anda memiliki coronavirus yang ringan dan asimptomatik, maka varietas yang parah kemungkinan besar tidak akan dapat menginfeksi Anda. Ya, saya mengetahui laporan infeksi ulang SARS-CoV-2. Tetapi ada beberapa opsi. Pertama, bisa jadi tes negatif palsu, yang awalnya menunjukkan pemulihan, dan sekali lagi memberikan hasil positif. Kedua, ada persentase tertentu dari pasien yang tidak membentuk imunitas berkepanjangan yang intens. Mereka hanya bisa mengandalkan kekebalan kawanan - kekebalan kerumunan.


Pohon filogenetik SARS-CoV-2. Pada sumbu horizontal, jumlah nukleotida berbeda. Sumber

Jika kita berbicara tentang filogeni SARS-CoV-2, maka itu tidak berbeda dalam kerentanan terhadap mutasi. Saat ini ada 48 varian terdaftar dari virus ini, dan cabang oranye terjauh dari Wuhan-Hu-1/2019, cabang oranye, hanya memiliki 12 nukleotida yang berbeda. Ini adalah sampel yang terdaftar di Finlandia dengan leluhur Italia.

Tampaknya, seleksi terhadap bentuk yang lebih ringan dapat bertahan selama bertahun-tahun jika pandemi tidak dapat dihancurkan.

Beralih ke tips: merokok itu buruk, tetapi sudah terlambat untuk mengguncang perahu


Seperti yang sudah diketahui, virus menggunakan reseptor membran untuk protein ACE2 (enzim pengonversi angiotensin) untuk fiksasi dan pemasukan awal ke dalam sel inang. Paling sering, reseptor ini ditemukan di epitel saluran pernapasan dan diekspresikan dalam jumlah tertentu oleh sel epitel rongga mulut. Semakin banyak ACE2 diekspresikan, semakin mudah bagi virus untuk menginfeksi tubuh dan berkembang biak selama penyakit tersebut. Ada beberapa faktor.

Pertama, Anda harus “beruntung” dengan genotipe. Protein ini dikodekan oleh dua varian gen I dan D. Oleh karena itu, kombinasi II, ID, DD dimungkinkan. Jika Anda menderita DD, maka selain risiko tinggi dalam hal penyakit kardiovaskular, Anda mendapatkan kerentanan tambahan terhadap SARS-CoV-2. Dengan demikian, kematian dalam populasi umat manusia yang berbeda dapat berbeda karena perbedaan dalam rasio genotipe.

Kedua, berhentilah merokok. Tidak, ini tidak akan membantu Anda untuk pandemi saat ini, tetapi bagaimanapun, ini merupakan faktor yang memberatkan. Saya menemukan cetakan yang menarik yang menunjukkan peningkatan ekspresi ACE2 pada perokok.


Level ekspresi ACE2 relatif pada sukarelawan dengan riwayat merokok yang berbeda. GSE994 - ekspresi di paru-paru, GSE17913 - ekspresi di rongga mulut.

Penelitian telah menunjukkan bahwa ekspresi secara signifikan lebih tinggi pada perokok bila dibandingkan dengan mereka yang tidak pernah merokok atau berhenti. Sayangnya, penelitian ini tidak menunjukkan berapa lama para mantan relawan berhenti merokok, tetapi kemungkinan besar itu sekitar 10+ tahun.
Gerbang utama untuk infeksi biasanya ringan, tetapi dengan peningkatan ekspresi di rongga mulut ada risiko lebih tinggi menerima dosis virus yang memberi hidup dengan hanya menjilati jari-jari Anda setelah kereta bawah tanah.


Ekspresi ACE2 pada tikus perokok.

Hasil yang sama didapatkan pada model tikus perokok, yang dipaksa menghirup asap tembakau secara berkala hingga lima bulan. Dalam hal ini, korelasi langsung diamati antara lama merokok pada tikus dan tingkat ekspresi.

Ringkasan: jika Anda seorang perokok tua, maka risiko kematian Anda sangat tinggi.

Tentang Umifenovir


Ada beberapa persiapan komersial yang cukup terkenal dengan umifenovir sebagai zat aktif. Ini cukup aktif dipromosikan di pasar domestik untuk pengobatan semua jenis penyakit virus.

Dalam penelitian tersebut, ia dibandingkan dengan plasebo. Hasilnya, kelompok plasebo memberi PCR negatif untuk coronavirus pada 71,8% kasus, dan umifenovir pada 82,6% kasus. Jadi, tablet tanpa zat aktif tidak memiliki perbedaan yang signifikan secara statistik dari umifenovir dalam hal efeknya pada tingkat pemulihan.

Kefanaan dan pengalaman manusia


Sebuah topik yang mengganggu semua orang dan paling banyak menimbulkan kontroversi. Seperti yang telah dikatakan berkali-kali, adalah tidak benar untuk mengukur angka kematian sebelum akhir epidemi, tetapi dapat ditentukan dengan satu kesalahan atau lainnya berdasarkan pada model epidemi. Ini persis situasi di mana bias seleksi naik ke ketinggian penuh: pasien dengan gejala berat tidak pergi ke dokter, tetapi hanya batuk sedikit dan menginfeksi orang lain.


Plague Ship - Diamond Princess

Untuk percobaan yang benar, Anda harus mengunci kerumunan orang di ruang terbatas, tunggu sampai semua orang sakit dan hitung jumlah orang yang selamat. Tentu saja, metode seperti itu tidak terlalu manusiawi, tetapi percobaan semacam itu ternyata terjadi secara tidak sengaja dalam insiden dengan Diamond Princess, ketika 3.600 orang dikarantina. Akibatnya, terlepas dari tindakan pencegahan dan pemindahan yang teratur dari yang terinfeksi ke rumah sakit, semakin banyak penumpang dan staf baru terinfeksi. Hasilnya adalah perkiraan yang baik untuk batas kematian yang lebih rendah - 1%. Mengingat bahwa penumpang di kapal pesiar sebagian besar berusia lanjut, dapat diasumsikan bahwa pada populasi umum tingkat kematian akan setidaknya 0,4-0,5%. Nomor reproduksi dasar adalah R0, dalam kasus liner adalah 2,8, yang sebanding dengan flu. Ini harus diperhatikanbahwa koefisien ini berlaku untuk kondisi karantina keras. Di kota besar tanpa acara khusus, ini bisa jauh lebih tinggi.
Batas atas sekarang diperkirakan sekitar 4%. Kelompok risiko utama adalah pasien usia lanjut ( sumber , data per 17 Februari):

Usia



Kematian



80+ tahun



14,8%



70-79 tahun



8,0%



60-69 tahun



3,6%



50-59 tahun



1,3%



40-49 tahun



0,4%



30-39 tahun



0,2%



20-29 tahun



0,2%



10-19 tahun



0,2%



0-9 tahun



0



Jangan jilat tangan Anda



Masalah terbesar dalam penyebaran virus adalah tangan. Jika Anda ingat, gerbang masuk adalah sel-sel rongga mulut dan saluran paru-paru yang mengekspresikan ACE2.

Respirator kelas FFP3 / N99 memberikan perlindungan terhadap aerosol virus. Selain itu, sangat disayangkan untuk mendapatkan di bawah awan partikel virus dalam tetesan air liur dan lendir setelah orang bersin. Rata-rata, awan di dalam ruangan seperti itu menggantung di udara tidak lebih dari lima menit, setelah itu diendapkan pada benda-benda di sekitarnya. Sangat menyenangkan ketika pasien batuk atau bersin di telapak tangannya, setelah itu dia menyentuh semua pegangan dan pegangan berturut-turut. Oleh karena itu, rekomendasi dangkal untuk secara teratur memproses pegangan pintu dan terus-menerus mencuci tangan lebih efektif, asalkan Anda tidak berada di dekat orang yang bersin.

Masker dan respirator, omong-omong, memiliki efek penting lainnya - mereka tidak memungkinkan Anda menyentuh bibir dan hidung Anda dengan tangan yang terinfeksi.


Ada serangkaian Legionbreaker cantik yang didedikasikan untuk kontaminasi. Ini menunjukkan dengan sangat jelas bagaimana Adam yang "terinfeksi" dengan sangat cepat menutupi dengan penanda ultraviolet di sekelilingnya, termasuk wajah rekan-rekannya.


Para pria, singkirkan hasrat yang tak tertahankan untuk menyentuh tangan satu sama lain.

Singkatnya, cuci tangan saya, usap keyboard dengan mouse dengan alkohol dan singkirkan cara untuk menyapa. Banyak kali saya melihat ritual aneh ini di ruang terbuka, ketika kerumunan orang menghabiskan waktu lima menit untuk saling menyentuh. Tentu, tidak ada yang mencuci tangan setelah kereta bawah tanah.

Apa yang harus Anda lakukan jika Anda secara relatif melindungi paru-paru Anda dari aerosol viral dengan respirator, tetapi di metro Anda dengan curiga membuat orang Italia yang mencurigakan dengan akar Asia berbicara di telepon dalam bahasa Farsi? Untuk memulainya, sama sekali tidak perlu untuk membungkus diri dalam kain putih dan segera merangkak menuju kuburan. Tetapi ini juga tidak berarti bahwa Anda harus berjalan sepanjang hari ditutupi dengan tetesan ludah asing dan lendir dari nasofaring. Ya, Anda tidak menghirup aerosol virus, tetapi beberapa partikel menempel pada selaput lendir mata. Selaput lendir mata itu sendiri, tampaknya, bukanlah pintu gerbang menuju infeksi, tetapi saluran nasolacrimal membasuh segalanya ke dalam nasofaring, tempat virus pada akhirnya bisa diperbaiki. Bahkan, dengan tidak adanya kacamata tertutup, mata menjadi pintu masuk tambahan untuk infeksi.

Anda memiliki beberapa cara untuk menyelesaikan masalah: jika Anda terbatuk tepat di pintu masuk rumah Anda, akan lebih baik untuk mencuci dengan baik, mencuci mata dengan seksama. Untuk mencuci, laboratorium kami memiliki blepharolotion . Bagian pertama dari pertanyaan yang saya dapatkan adalah tentang dia. Tidak, bahkan jika Anda membersihkan kelopak mata sesuai petunjuk, ini tidak akan membantu dari virus. Lebih tepatnya, ini akan membantu dengan cara yang sama seperti mencuci dengan air. Tapi blepharolotion dikembangkan untuk kelopak mata, jadi ketika mencuci itu kurang melukai kelopak mata yang sama. Lebih baik untuk mencuci dengan peralatan khusus dan berjalan bersih daripada tidak mencuci sama sekali. Tetapi lebih baik mencuci dengan air daripada menjadi kotor.

Lebih buruk lagi, jika tidak ada cara untuk sepenuhnya mencuci dengan sabun. Yang paling penting - jangan tuangkan pembersih agresif ke mata Anda - Anda akan mendapatkan luka bakar kimia. Hampir semua protokol medis untuk kontak dengan cairan yang terkontaminasi secara biologis di mata melibatkan pencucian dengan larutan netral. Kornea adalah struktur yang sangat peka dan mudah rusak secara permanen oleh obat-obatan yang tidak sesuai. Dalam hal memproses dengan hal-hal netral, bagian dari virion akan terhapus dari permukaan. Beberapa saat kemudian, sudah sepenuhnya cuci mata Anda ketika Anda dapat menemukan wastafel. Juga nyaman menggunakan blepharosafe sterilkami telah mengembangkan untuk merawat kulit di sekitar mata. Kami melakukannya untuk resusitasi dan untuk yang lain, tetapi pada akhirnya mereka ada di hampir setiap apotek dalam paket individual "untuk menyeka mata" (sebenarnya seabad). Ini bekerja dengan sangat baik. Tidak, dia tidak melawan makeup. Tidak, virus tidak menghancurkan, tetapi sedikit mengurangi risiko. Seperti air.



Oleh karena itu, prinsip umum adalah bahwa pelindung mata diperlukan (pakaian antariksa), atau mencuci diri tepat waktu, atau tidak berjalan-jalan di tempat umum di mana Anda dapat bersin di wajah Anda. Dilihat dari kesimpulan ahli epidemiologi Tiongkok , jarak setidaknya 4,5 meter dapat dianggap aman. Anda tidak akan pergi ke mana pun di kereta bawah tanah, tetapi sudah ada orang-orang istimewa yang berdiri di sana yang mengukur suhu dengan imager termal, jadi, secara logis, semuanya harus relatif baik.

More articles:


All Articles