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Mon tableau de bord et analyse de la dynamique de propagation de l'infection COVID-19



Je souhaite partager mon tableau de bord et l'analyse de la dynamique de propagation de l'infection. Le tableau de bord est écrit dans Google Sheets et Google Apps Script.

UFO Care Minute


COVID-19 — , SARS-CoV-2 (2019-nCoV). — , /, .



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Remarque: L'auteur ne prétend pas être des données objectives. De nombreux facteurs directs et indirects affectent la fiabilité des statistiques actuelles. À la fin de la pandémie, une recherche professionnelle et une méta-analyse seront menées qui permettront une évaluation objective de la pandémie en nombre. Cet article a été publié afin de nous familiariser avec un outil d'analyse de la dynamique de propagation de l'infection basé sur les données publiées par l' OMS dans ses rapports.

Des tableaux de bord sont disponibles à cette adresse . Les données sont automatiquement mises à jour quotidiennement à mesure que les rapports de l'OMS sont publiés. Le contenu ne s'adapte pas aux appareils mobiles. Mieux vaut regarder sur grand écran.

Pourquoi


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  • Il est pratique d'ouvrir le portable le matin et sur un écran pour découvrir ce qui s'est passé au cours de la dernière journée.
  • Il s'agit d'une excellente occasion de vous entraîner avec Google Sheets et Google Apps Script.


Les données


Au départ, j'ai utilisé les données des rapports de l' OMS , mais ils ont soit fait des erreurs lors du transfert des données des rapports vers la base de données, soit changé le temps par rapport auquel de nouvelles infections étaient envisagées. En conséquence, j'ai réécrit les scripts pour utiliser les données de l' ECDC . Il s'agit des mêmes données de l'OMS, mais avec un temps de publication stable et sans erreur.

Que regarder




  • Informateurs. Ils affichent les dynamiques clés actuelles dans le monde;
  • La dynamique du nombre total de cas d'infection dans le monde (TOTAL DES CAS);
  • La dynamique des nouvelles infections dans le monde (NOUVEAUX CAS QUOTIDIENS);
  • La dynamique de la propagation des infections et des décès par pays;
  • Évaluer visuellement la situation sur la carte du monde;
  • Dynamique de mortalité (CFR);
  • La durée de la période de pointe de l'épidémie par pays;
  • Corrélation du large indice S&P 500 avec le nombre de nouvelles infections;
  • Découvrez à quel point la situation dans un pays est critique, ajustée pour la population de ce pays.


Mortalité (CFR)




Il y a beaucoup de débats sur Internet sur la létalité du nouveau coronavirus, il y a des articles sur Habré. Je ne veux pas entrer dans une autre controverse, je me contente d'opérer sur les données dont nous disposons.

Oui, il y a certainement des problèmes dans la collecte des statistiques, il y a des problèmes dans les tests de masse, qui permettraient de juger plus précisément la mortalité. L'exactitude des données est également affectée par des éléments tels que l'épidémie de grippe saisonnière en Europe, la mortalité élevée en général dans certains pays, comme l'Inde, qui, éventuellement combinée à des problèmes d'infrastructure de santé, érode simplement les statistiques de mortalité du nouveau coronavirus. J'avoue que dans les pays où le nombre d'infections est élevé, en raison de la charge du système de santé, il est tout simplement impossible de déterminer la cause du décès en temps opportun ou, au contraire, de l'attribuer à un nouveau virus. Mais, vous pouvez certainement dire avec certitude que beaucoup ont sous-estimé la criticité de la situation.

Les gens confondent mortalité et mortalité . Selon qui et Taux de mortalité des CDC pour la grippe saisonnière - 0,1% , pour le coronavirus SARS-CoV-2 - 4,45% au moment de la rédaction (26.03.2020). Dans certains pays, comme l'Italie, la mortalité atteint actuellement 9%.

Oui, la létalité du nouveau coronavirus n'est pas aussi élevée que celle du MERS-CoV et d'Ebola (34% et 50%), mais la contagiosité , la virulence , la vitesse et l'étendue de la propagation du nouveau coronavirus ne peuvent pas être comparées - elles sont beaucoup plus élevées.

Heure de pointe


Pour travailler, j'avais besoin de savoir combien de temps dure la période de pointe de l'épidémie dans un pays donné. Si nous tenons compte du fait que la plupart des pays prendront des mesures plus ou moins proportionnées de la quarantaine totale, puis sur la base de l'expérience d'autres pays, il sera possible de juger du moment où l'épidémie diminuera dans un pays particulier.

Je n'ai trouvé aucune méthodologie pour déterminer la période de pointe, j'ai donc dû improviser. Sur la base de la dynamique en termes de nombre de nouvelles infections, j'ai décidé de déterminer l'importance des nouvelles infections sur la base desquelles il serait possible de juger si le pic de l'épidémie est passé ou si le pays est en période de pic. La moyenne et la médiane ne correspondaient pas tout à fait, j'ai donc décidé d'utiliser Quartile. J'ai supprimé les jours avec une valeur nulle d'un échantillon de données sur les nouvelles infections, après cette normalisation, j'ai utilisé la fonction pour déterminer la valeur du troisième quartile. En outre, la formule tient compte du nombre de jours qui dépassent la valeur du troisième quartile - c'est la durée de la période de pointe.

Si vous appliquez ce calcul pour tous les pays, il peut être utilisé pour comparer la période de pointe pour les pays.

La période de pointe reflétera de manière plus fiable la situation vers la fin de l'épidémie. Vous pouvez regarder les chronologies de la Chine et de la Corée du Sud, où le pic de l'épidémie est passé. Malgré le fait que de nouvelles infections soient toujours présentes en Chine et en Corée du Sud, le calcul de la période de pointe reflète parfaitement l'efficacité des méthodes notoires de quarantaine totale et des méthodes de lissage des courbes adoptées en Corée du Sud. Gardez à l'esprit qu'il existe un risque de deuxième vague d'épidémie en Asie du Sud. En raison de la suppression rapide de la quarantaine ou de l'importation du virus des pays voisins, où l'épidémie ne fait que commencer. Par conséquent, la période de pointe peut augmenter.

Tableau récapitulatif par pays


Il affiche toutes les informations clés par pays, et il existe également des délais par lesquels vous pouvez évaluer visuellement la courbe épidémique.



Données de la carte du monde


La visualisation sur la carte vous permet d'évaluer les foyers d'infection actuels.



Ce que je prévois d'ajouter


  • Tableaux séparés sur le nombre d'infections ajusté pour la population ;
  • Visualisation de la dynamique sur des cartes du monde ajustées pour la population ;
  • Mettez en évidence visuellement les périodes de pointe si une épidémie dans un pays particulier est actuellement en période de pointe.


Retour d'information


Je serai heureux d'entendre vos souhaits et recommandations pour rendre le tableau de bord encore plus informatif.

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