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"Pandémie" de publications scientifiques sur COVID-19

Dans la société de l'information moderne, tout processus socialement important qui affecte également la sécurité et la santé des citoyens s'accompagne d'un flux de fausses informations. Plus il y a de participants au processus et plus le sujet est complexe, plus l'espace de manipulation et la propagation de la désinformation sont larges. Une telle désinformation peut être plus dangereuse que l'événement qui a créé la menace.



Les informations sur la maladie COVID-19 dominent aujourd'hui toutes les autres et s'accompagnent de nombreuses fausses informations. À cet égard, il existe un besoin d'informations fiables, qui peuvent être obtenues avec une certaine compétence dans des revues scientifiques à comité de lecture.

De nombreuses bibliothèques et revues scientifiques électroniques (comme le National Center for Immunization and Respiratory Diseases, le JAMA Network, Elsevier) ont organisé des sections spéciales des publications sur le coronavirus SARS-CoV-2 sur leurs sites Web. Cependant, plus de 10 articles scientifiques sont publiés par jour sur ce sujet. Comprendre ce flux d'informations n'est pas facile. Si la publication sur les coronavirus la plus citée depuis 2003 depuis 18 ans a attiré plus de 3400 sources (selon Google Scholar), alors l'article Caractéristiques cliniques des patients infectés par le nouveau coronavirus 2019 à Wuhan a déjà été cité par plus de 900 sources, malgré le fait que cet article ait été publié il y a juste un mois! Cette situation peut être qualifiée de «pandémie» d'articles scientifiques sur COVID-19.

Essayons de structurer le flux des publications et d'identifier des modèles intéressants. En raison du manque de connaissances particulières dans le domaine de la médecine, cet article ne présente que les résultats d'une analyse bibliométrique, sans tenter d'interpréter les faits révélés dans le contexte de la virologie.

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La pandémie COVID-19, une infection respiratoire aiguë potentiellement grave causée par le coronavirus SARS-CoV-2 (2019-nCoV), a été officiellement annoncée dans le monde. Il y a beaucoup d'informations sur Habré sur ce sujet - rappelez-vous toujours qu'il peut être à la fois fiable / utile, et vice versa.

Nous vous invitons à critiquer toute information publiée.


Sources officielles

, .

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Caractéristiques des données source


Les données sources étaient des informations sur plus de 10000 publications universitaires collectées le 20 mars 2020 à l'aide du moteur de recherche Google Scholar. Malheureusement, peu de publications nationales sont indexées dans ce système de recherche en raison du fait que le principal système bibliométrique russe eLibrary dispose d'un solide système de protection contre la collecte de données.

Au total, trois requêtes de recherche ont été effectuées pour les mots clés suivants: «COVID-19» , «coronavirus» et «SARS-CoV-2» (figure 1).

Figure. 1 - Résultats de la recherche de publications scientifiques par mots-clés

Le nom de la maladie COVID-19 est utilisé plus souvent dans les publications scientifiques que le nom du virus SARS-CoV-2. Total des articles et des livres sur les coronavirus, ainsi que des sujets connexes, selon Google Scholar plus de 150 000. Les statistiques annuelles pour les publications collectées sont présentées dans la figure 2.

Fig. 2 - Répartition des informations collectées sur les publications par année

Deux pics peuvent être observés dans le diagramme, se référant à 2003 et 2012. Ces pics correspondent à deux flambées d'infections à coronavirus: le SRAS-CoV (syndrome respiratoire aigu sévère, appelé SRAS) et le MERS-CoV (syndrome respiratoire du Moyen-Orient). Malgré le fait que la collecte d'informations sur les publications se soit concentrée sur les plus récentes, il est difficile de ne pas remarquer un bond de l'activité scientifique en raison de la situation actuelle avec la pandémie de COVID-19. Cette tendance peut également être observée dans la dynamique de citation des articles les plus populaires sur ce sujet. La publication Identification d'un nouveau coronavirus chez les patients atteints d'un syndrome respiratoire aigu sévère sur le coronavirus depuis 2003 depuis 18 ans, selon Google Scholar, a attiré plus de 3400 sources. Dans cette publicationLes caractéristiques cliniques des patients infectés par le nouveau coronavirus 2019 à Wuhan à propos d'un nouveau coronavirus en seulement un mois ont déjà plus de 900 citations! Cette situation est appelée une «pandémie» d'articles scientifiques sur COVID-19, car elle a affecté des scientifiques du monde entier. L'étude d'un tel volume accru de publications nécessite l'utilisation de méthodes d'analyse spéciales, qui seront démontrées dans cet article.

Carte des publications scientifiques sur le thème "Coronavirus"


L'analyse sous forme graphique à l'aide de cartes semble pratique et intuitive. Des informations supplémentaires sur les publications scientifiques peuvent être obtenues en considérant le lien thématique entre elles, comme indiqué dans la citation. Sur la base des données collectées, un graphique de citation a été construit, dont le cœur est représenté par commodité sous forme de carte thermique (figure 3).

Figure. 3 - Carte des publications scientifiques sur le thème "Coronavirus"

Présentée à la figure 3.A, la carte forme un espace sémantique dans lequel chaque section a un focus thématique spécifique. La proximité de la publication détermine leur similitude thématique. L'agencement mutuel des sites thématiques est déterminé par les liens entre les thèmes de recherche pertinents. Ceux. plus les deux zones de la carte sont proches l'une de l'autre, plus elles se ressemblent sur le thème de la recherche.

Sur la carte (figure 3.A), deux grands groupes peuvent être observés. Le cluster situé sur le côté gauche de la carte (secteurs 6-11, figure 3.A) contient les résultats des études sur les coronavirus menées avant l'avènement de COVID-19. En témoigne la répartition du nombre de publications trouvées par les requêtes de recherche "COVID-19" (figure 3.B) et«Coronavirus (après 2020)» (figure 3.B). Les publications trouvées par la demande «SARS-CoV-2» (figure 4.E) sont présentes à la fois dans les grappes de gauche et de droite (secteur 3, figure 3.A).

Outre le thème des clusters, il est important de comprendre à quelle heure leurs publications ont été publiées. La figure 4 montre la chronologie du placement des articles scientifiques et des livres sur le sujet «Coronavirus», où l'année de publication est indiquée en couleur.


Figure. 4 - Illustration de la chronologie de l'apparition des publications scientifiques sur les coronavirus

Les premières publications se situent dans le coin supérieur gauche de la carte, publications pour 2020 - dans un groupe distinct à droite.

Les informations sur la chronologie nous permettent de retracer les relations de cause à effet entre les régions et l'évolution des thèmes.

Présentation du cluster thématique


Examinons plus en détail les principales zones de la carte construite (figure 5).


Figure. 5 - Carte des publications scientifiques sur le thème "Coronavirus" avec les domaines thématiques marqués dessus. Les

publications du cluster principal sont consacrées à l'étude des virus. Sa partie supérieure comprend des publications antérieures, dans lesquelles une plus grande attention est accordée à l'étude de la structure protéique des virus. Dans la partie inférieure de la région sont concentrés les résultats d'études de coronavirus spécifiques, notamment le SRAS (2003) et le MERS (2012).

Fin 2002 et début 2003, une maladie est apparue, appelée «pneumonie atypique» dans les médias. Le virus s'est propagé en Asie. Pour tout le temps, plus de 8 000 cas d'infection ont été notés, dont plus de 800 mortels. Le pic de publications, qui a été noté plus tôt, est associé à cette maladie, et les publications elles-mêmes sont localisées de manière compacte dans la zone du SRAS (figure 5).

Le domaine MERS-CoV comprend des publications relatives au syndrome respiratoire du Moyen-Orient 2012, qui ont été distribuées dans 23 pays, dont l'Arabie saoudite, le Yémen, les Émirats arabes unis, la France, l'Allemagne, l'Italie.

Trois grappes isolées sur le côté gauche de la carte (zone 3, secteur 8, figure 3.A) concernent l'étude des virus chez les animaux (chats, chiens et bovins).

Le côté droit de la carte contient des publications sur COVID-19 et ses conséquences pour la société. Le cluster COVID-19 a une structure complexe et se compose de sections thématiques liées à la fois à l'étude du virus lui-même et à la modélisation de sa propagation. Il existe également un domaine distinct de publications concernant les particularités de révéler une maladie par des méthodes de radiologie.

Entre les deux grands groupes des parties gauche et droite de la carte, il y a un «pont» d'environ 20 publications (secteurs 3 et 4 de la zone 2, figure 3.A). Ces publications ont des liens de citation, et les publications connexes sont situées dans des groupes opposés dans des proportions approximativement égales. Parmi ces publications figurent des sujets sur le développement d'un vaccin, sur l'identification de l'origine du virus, ainsi que sur le pronostic de sa propagation, en tenant compte de l'analyse des données disponibles sur des infections similaires.

La carte construite vous permet de voir visuellement la relation "naturelle" entre les différents sujets de recherche des coronavirus et peut être utilisée comme un outil intuitif et visuel pour analyser la concentration thématique des équipes d'auteurs, des revues scientifiques et d'autres objets de recherche. Cette fonctionnalité sera illustrée dans les sections suivantes.

Analyse de l'activité des auteurs


Pour les publications à l'étude, plus de 3000 auteurs ont été identifiés, 50 d'entre eux (avec le plus grand nombre de publications) sont présentés dans le diagramme (figure 6).


Figure. 6 - 50 auteurs les plus publiés sur le thème «Coronavirus». Pour

déterminer les statistiques sur les auteurs, seuls leurs noms de famille et leurs initiales ont été utilisés. Cette approche présente plusieurs inconvénients, car d'une part, les mêmes personnes peuvent être considérées comme différentes en raison des différences d'orthographe des noms de famille dans leur langue maternelle et en anglais. En revanche, deux auteurs différents peuvent être enregistrés comme une seule personne s'ils ont les mêmes noms de famille et initiales (ce problème est particulièrement pertinent pour les auteurs chinois, qui sont les plus concernés par le sujet sur COVID-19). Pour cette raison, le nombre réel d'auteurs et de leurs publications différera des statistiques fournies.

Tenez compte de la concentration thématique des auteurs les plus actifs. La figure 7 montre des cartes thématiques personnalisées des 7 auteurs les plus publiés. Des cartes personnelles ont été construites à partir de la carte des publications scientifiques publiée précédemment sur le thème «Coronavirus».


Figure. 7 - Cartes thématiques personnelles pour les sept auteurs de coronavirus les plus publiés Les

professeurs Patrick Cy Woo et Susanna Kar Pui Lau sont membres du Département de microbiologie de l'Université de Hong Kong. Les auteurs ont plus de 100 publications (dont au moins 40 sont liées à l'étude des coronavirus). Ils ont des indices de Hirsch assez élevés, mais jusqu'à présent aucune publication n'a été enregistrée sur le sujet COVID-19.

En raison de la prévalence du nom de famille Lee, plusieurs personnes peuvent être représentées sous le profil Y Li à la fois: Yun Li (Yun Li, professeur à l'Université du Michigan ou professeur à l'Université de Toronto), Lei Yuan (Lei Yuan, un employé de l'Université de Wuhan) et d'autres. Pour cette raison, il n'est pas logique d'analyser l'activité des publications de ce profil. Des considérations similaires s'appliquent aux profils de W Li , J Chen et Y Yang .

Dr. Ziad A. Memish) est actuellement consultant principal en maladies infectieuses et chef du service de recherche de l'hôpital Prince Mohammed bin Abdel Aziz de Riyad (ministère de la Santé d'Arabie saoudite). Il est également professeur au Collège de médecine de l'Université Alfaisal (Riyad, Arabie saoudite) et professeur agrégé au Département de la santé mondiale. Hubert (Rollins School of Public Health, Emory University, Géorgie, États-Unis).

Ziad Memish est reconnu par la communauté d'experts comme un spécialiste de la lutte contre les maladies infectieuses. Membre du conseil d'administration de la Société internationale des maladies infectieuses. Il a de nombreux prix différents, une grande liste de publications scientifiques et de rapports lors de conférences internationales, est le rédacteur en chef de deux revues (Journal of Epidemiology and Global Health). La plupart de ses publications sur les coronavirus se trouvent dans le secteur 6 de la zone 3 (figure 3.A), qui comprend des publications sur la maladie respiratoire du Moyen-Orient. Leur temps de publication est pour la période de propagation de la maladie. À ce stade, Ziad Memish a été sous-ministre de la Santé de l'Arabie saoudite.

Au sujet de COVID-19 sur la carte de Ziad Memish, il existe quatre publications consacrées au diagnostic et à la lutte contre la propagation massive du virus.

Ainsi, à la suite de l'analyse de l'activité personnelle, il peut être établi que la flambée des publications en 2020 appartient aux auteurs chinois qui, en raison de la prévalence des noms de famille et des initiales lors de l'analyse bibliométrique, peuvent être confondus avec les mêmes personnes. Des chercheurs de niveau international ont montré une activité modérée en ce qui concerne la publication d'informations sur le coronavirus et sa maladie associée COVID-19.

Analyse de l'activité des éditeurs


De nombreuses ressources d'information (y compris Habr) pour un accès plus pratique aux informations sur COVID-19 sur leurs sites Web ont organisé des sections spéciales où les informations pertinentes sont agrégées. Simplifier l'accès à des informations vérifiées est un bon moyen de lutter contre la propagation de fausses informations, ce qui peut entraîner des conséquences négatives. Les éditeurs scientifiques utilisent également cette approche. Dans le même temps, il est nécessaire de noter une responsabilité supplémentaire pour assurer la fiabilité et la qualité des informations publiées par ces organisations. En publiant des informations insuffisamment vérifiées, les éditeurs courent le risque de distraire ou d'induire en erreur les scientifiques menant des recherches, ce qui peut conduire à une diminution de l'efficacité de la lutte contre les coronavirus.

Dans le cadre de l'augmentation du volume de travail sur la revue des articles scientifiques, il semble intéressant d'étudier l'activité des éditeurs par rapport au sujet en discussion. Pour ce faire, la figure 8 présente des statistiques sur le placement d'articles scientifiques dans la source correspondante, et pour les sources, des estimations comparatives du nombre total de publications sur les coronavirus trouvées et du nombre de publications sur le sujet COVID-19 sont également présentées.


Figure. 8 - Statistiques sur le nombre de publications collectées pour les magazines et les plateformes bibliométriques (le bleu clair indique le nombre total de publications collectées sur le thème «Coronavirus», le bleu foncé indique le nombre de publications sur le thème COVID-19)

Il convient de noter qu'une grande proportion des publications sur le thème COVID -19 composent les soi-disant pré - impressionsarticles c.-à-d. les articles publiés avant leur publication officielle dans une revue scientifique à comité de lecture (ces articles sont disponibles sur medrxiv.org et arxiv.org). D'une part, le placement des préimpressions permet aux scientifiques de déclarer leur supériorité dans l'obtention de résultats scientifiques plus tôt que les autres, et d'autre part, de corriger les inexactitudes qui peuvent être identifiées avant la publication officielle de l'article. Cela réduit la possibilité d'une utilisation commerciale des résultats de leur propriété intellectuelle, car les données seront accessibles au public. Un grand nombre de prépublications d'articles sur le sujet n'est pas surprenant, car en raison de sa pertinence, les chercheurs cherchent à publier les résultats de leurs recherches le plus tôt possible, sans attendre l'achèvement des procédures d'examen prévues par les éditeurs scientifiques officiels.Une autre caractéristique intéressante est la disponibilité de sources qui n'ont pas de publications sur le sujet COVID-19, malgré la disponibilité d'articles sur d'autres sujets liés aux coronavirus. Cette fonctionnalité sera discutée plus en détail ci-dessous.

Nous utilisons la carte construite pour l'analyse des revues scientifiques de la même manière que nous l'avons utilisée pour analyser l'activité des auteurs. La figure 9 montre les cartes thématiques des revues et bibliothèques électroniques examinées.


Figure. 9 - Cartes thématiques de revues scientifiques et bibliothèques électroniques publiant des informations sur le thème Coronavirus

ScienceDirect (sciencedirect.com) . Le système d'accès aux revues scientifiques, mis en œuvre par l'une des plus grandes maisons d'édition mondiales Elsevier (qui gère également la base de données des publications scientifiques Scopus). Le système donne accès (payant et gratuit) aux publications de plus de 2600 revues scientifiques. La critique de cette maison d'édition vise principalement une commercialisation excessive de l'activité scientifique.

ScienceDirect représente 14% des publications qui entrent au cœur des données collectées. Tous les sujets traités sur les coronavirus sont couverts (figure 9.A), et la dynamique de publication correspond aux statistiques générales. Les sujets concernant le coronavirus de 2003 et la maladie respiratoire du Moyen-Orient de 2012 sont mis en évidence proportionnellement. Le thème de la modélisation et des mécanismes de propagation de la maladie COVID-19 est présenté dans un volume plus petit par rapport au thème des études cliniques du virus.

Journal de virologie (jvi.asm.org). Journal of Virology est une revue à comité de lecture et est publiée depuis 1967. Actuellement, les articles sont publiés électroniquement toutes les deux semaines. La revue couvre les résultats d'études sur la nature des virus, rend compte de nouvelles découvertes et indique de nouvelles directions dans la recherche. Les articles de recherche originaux couvrent les virus des animaux, des archées, des bactéries, des champignons, des plantes et des protozoaires. Parmi les problèmes clés qui sont étudiés: analyse de la structure des virus, réplication du génome viral, évolution des virus, interaction des virus et des cellules, etc.

La carte thématique (figure 9.B) montre que dans cette revue pratiquement tous les sujets sur les coronavirus sont couverts, par sauf pour COVID-19. Une seule publication a été collectée sur ce sujet (Reconnaissance des récepteurs par le nouveau coronavirus de Wuhan: une analyse basée sur des études structurelles sur une décennie du coronavirus du SRAS ). Dans ce document, au lieu du terme COVID-19, 2019-nCoV est utilisé, selon lequel 2 autres publications liées au sujet COVID-19 ont été découvertes manuellement sur le site Web de l'éditeur. Un si petit nombre de publications (par rapport à d'autres éditeurs), malgré la large couverture d'autres infections virales, est probablement dû à la politique éditoriale, aux exigences élevées et à l'examen minutieux des documents publiés (le site Web indique que le temps de réponse moyen de l'éditeur pour l'acceptation est de 27 jours, le délai entre une décision positive et la publication est de 11 jours).

Il est également intéressant de comparer la chronologie de la publication dans cette revue et dans le système ScienceDirect considéré. Ces sources présentent des similitudes tant dans la couverture que dans le nombre approximatif de publications qui entrent au cœur des données collectées. Dans le même temps, la dynamique des publications dans ScienceDirect pour les flambées d'infections virales en 2003 et 2012 semble similaire, tandis que pour Journal of Virology, l'activité s'estompe. Cela peut être dû à la fois à une diminution de l'intérêt pour les thèmes des coronavirus ou des ressources de publication et à des politiques éditoriales ciblées (par exemple, des exigences supplémentaires pour la nouveauté scientifique de la technologie de recherche).

Centre national d'information sur la biotechnologie (ncbi.nlm.nih.gov). Le US National Center for Biotechnology Information a été créé en 1988 pour traiter et stocker les données de biologie moléculaire. Le NCBI gère une base de données des domaines protéiques, de l'ADN, (GenBank) et de l'ARN, des articles scientifiques médicaux et biologiques (PubMed) et de la taxonomie des espèces (TaxBrowser).

Cette source contient un peu plus de 4% des publications collectées dans le noyau. Presque toutes les publications ont été publiées après 2003 (figure 9.B), cette source n'est donc pratiquement pas présentée en haut de la carte thématique. Cette source contient également une faible couverture des sujets liés aux virus d'animaux de compagnie. Les articles scientifiques de COVID-19 sont principalement situés dans la partie centrale du cluster correspondant et sont consacrés aux études cliniques du virus, ainsi qu'à la prédiction de sa propagation.

SpringerLink (link.springer.com) . Système d'accès aux revues scientifiques de la maison d'édition Springer, spécialisée dans les travaux en sciences naturelles. La distribution des publications sur le thème «Coronavirus» et au fil des ans dans SpringerLink est comparable à Elsevier, mais dans un volume plus petit (environ 3 fois, figure 9.G). Parmi les caractéristiques des statistiques de publications, on peut noter un grand nombre de publications datant de 1995, qui révèlent principalement les résultats d'études de coronavirus chez l'animal (y compris domestique). Les principales directions des publications sur COVID-19 sont les études cliniques et la modélisation des conséquences.

medRxiv (medrxiv.org). Une ressource en ligne gratuite pour publier des articles et des monographies (prépublications) complets mais non publiés dans le domaine des soins de santé. Le plus grand nombre de publications sur le sujet de COVID-19 est actuellement publié par cette même source (figures 8, 9.E). Cette source n'a pas été mentionnée dans les publications sur d'autres sujets concernant le coronavirus.

Bibliothèque en ligne de Wiley (onlinelibrary.wiley.com) . Système d'accès au journal scientifique Wiley similaire à Elsevier et Springer. Wiley a compilé une sélection de plus de 5 000 articles de recherche ouverts liés à COVID-19. La plupart des publications sur COVID-19 concernent les résultats d'études sur la structure de SARS-CoV-2.

Oxford University Press (academique.oup.com). La source publie des articles de plus de 300 revues dans les sciences humaines, les sciences sociales, la jurisprudence, la science et la médecine, dont les deux tiers sont publiés en collaboration avec des organisations scientifiques et professionnelles.
Les publications d'Oxford University Press sur les coronavirus visent principalement à l'étude de coronavirus humains spécifiques. En ce qui concerne COVID-19, 16 publications ont été collectées, qui visent principalement à étudier l'origine et les mécanismes de la propagation du virus du SRAS-CoV-2.

Nature (nature.com). Elle est l'une des revues scientifiques les plus anciennes et les plus respectées dans le domaine des sciences naturelles, compte plus d'un million de lecteurs par mois. Pour cette revue (figure 9.I), une «flambée» de publications sur les coronavirus pour 2016 est à noter. Ces statistiques diffèrent des autres sources considérées. Cette année, les résultats d'études sur la structure des coronavirus ont été principalement publiés (par exemple, SRAS et MERS: aperçus récents sur les coronavirus émergents ). Les publications ont une cote de citation assez élevée en raison de la crédibilité de la revue.

Toutes les sources considérées disposent de moteurs de recherche pratiques et peuvent être utilisées pour identifier en temps opportun les résultats des études pertinentes sur les coronavirus.

Étude de publications sur l'origine du SRAS-CoV-2


Il est également intéressant d'utiliser la carte développée pour étudier des sujets sur les coronavirus qui suscitent la controverse et les discussions scientifiques. L'une d'elles est la version sur l'origine artificielle du coronavirus associée à la publication Virus de chauve-souris artificielle suscite un débat sur les recherches risquées . Cette publication n'a pas été trouvée lors de la collecte de données en raison de sa faible note en raison de l'absence de liens de citation (ce qui est une circonstance étrange car elle a été publiée par l'éditeur réputé Nature). Cette publication n'est pas non plus mentionnée dans l'article de deux pages Aucune preuve crédible à l'appui des allégations de l'ingénierie de laboratoire du SARS-CoV-2, qui allègue des preuves insuffisantes de l'origine artificielle du virus du SRAS-CoV-2 (figure 10).


Figure. 10 - Sélection de publications sur le sujet lié à l'origine du SRAS-CoV-2

À cet égard, les résultats de recherche publiés dans l'article susmentionné Receptor Recognition by the Novel Coronavirus from Wuhan: an Analysis Based on Decade-Long-Decennial Structural Studies of SRAS présentent un intérêt particulier. Coronavirus du Journal of Virology. Cependant, en raison du manque de connaissances spécialisées dans le domaine du génie génétique, une analyse plus approfondie n'est pas possible.

résultats


Pour résumer la présente revue, il est nécessaire de noter l'importance d'un accès rapide aux résultats de la recherche scientifique pour lutter contre la désinformation. Cependant, le volume excessif d'informations publiées, ainsi que la complexité scientifique du sujet, réduisent l'efficacité d'une telle contre-action. Un grand nombre de résultats publiés alourdissent le fardeau des lecteurs et des examinateurs qui vérifient l'exactitude des résultats. Cette situation est caractéristique non seulement pour des événements rares comme la pandémie de coronavirus, mais aussi pour l'ensemble de l'industrie scientifique. L'analyse nécessite de nouvelles approches du traitement de l'information, dont l'une a été démontrée dans cet article.

Les informations obtenues sur les publications scientifiques collectées qui ont été corrigées à la base peuvent être utiles aux spécialistes.Par conséquent, elles sont présentées dans le tableau sous une forme distincte.fichier xlsx .

PS Dans les commentaires, il est intéressant d'entendre l'avis d'experts sur la politique éditoriale du Journal of Virology, ainsi que sur la fiabilité de la version artificielle de SARS-CoV-2.

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