Essayer de faire face aux différences frappantes de mortalité par coronavirus en Italie et en Corée du Sud

Le premier cas confirmé de coronavirus en Italie et en Corée du Sud vers le 20 janvier. La population est de 60 millions d'habitants en Italie et de 51 millions en Corée du Sud.

Fin 11 mars 2020 en Italie, 12 462 cas confirmés et 827 décès, ~ 6,6%. En Corée du Sud - 7755, 61, ~ 0,77%. (chiffres d'ici [1]).

En Italie, la situation est presque d'un ordre de grandeur pire (8,5 fois). Mais pourquoi? Essayons de comprendre au moins partiellement.



Avertissement Je ne suis ni médecin ni biologiste.

Dans le cadre de ce texte, je jouerai pour les mathématiques avec l'expérience de la bioinformatique.

Par conséquent, le raisonnement peut ne pas être pertinent pour la réalité. En revanche, tous les faits seront confirmés par pruflinki.

Si vous avez des faits avec pruflinks - brûlez!

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Donc. Pour commencer, à cause de quels nombres pourraient être différents du tout. Nous essaierons ensuite d'évaluer ces effets.

  1. Répartition différente de la population selon les groupes d'âge. A en juger par les statistiques, il existe une dépendance très importante de la mortalité à l'âge [2, 3].
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A en juger par les statistiques, il existe une dépendance très importante de la mortalité à l'âge [2, 3]. Ces chiffres viennent de Chine. En Corée [9], les ratios sont très similaires, bien que les valeurs absolues soient inférieures.



En Chine, les personnes âgées de 60 ans et plus donnent 80% des décès, en Corée - 86%.
En Corée, 11,4% de la population a plus de 64 ans et en Italie - 20,3% [7, 8].

Si nous supposons que toute la mortalité se situe dans cette catégorie d'âge, cela devrait donner un facteur de 20,3 / 11,4≈1,8.

En fait, il se trouve que, en Corée, une grande partie des cas sont des jeunes filles à faible risque.

Si nous calculons la proportion de cas confirmés avec un âge> 50, nous obtenons les chiffres suivants:
3021 / (3021 + 4492) ≈40% pour la Corée [4], 39,2 + 37,4 = 76,6% pour l'Italie [10] (les chiffres sont boueux, mieux que les statistiques a trouvé).

Encore une fois, si vous transférez toute la létalité dans cette catégorie, vous obtenez 76,6 / 40 = 1,92 (soit dit en passant, très proche de 1,8, ce qui est bien).





Compter les malades


En Corée du Sud, il y a maintenant pas mal de tests: le 11 mars, plus de 220K tests y étaient déjà effectués [4], contre ~ 60K en Italie [5] (voir aussi [6]).

Les Coréens contractent 7755 / 220K≈3,5% d'infections par test.
Les Italiens - 12462 / 73154≈17%.

En conséquence, en Corée, l'échantillon a très probablement des cas plus bénins qui passent sans complications.

Mais comment l'évaluer? Je ne pouvais pas comprendre comment le faire en fonction des données que j'ai réussi à trouver.

On pourrait comparer la reprise. Les cas bénins devraient disparaître en quelques semaines, les cas graves en 4 à 6 semaines.

Mais en Italie, il y a environ 1000 récupérations, contre 300 en Corée [1, 11]. Ne convient pas. Si vous regardez les cas actifs très sévères, il y a 1028 / 10590≈9,7% en Italie contre 54 / 7470≈0,7% en Corée [11].

Peut-être que ces chiffres signifient simplement qu'en Italie, il y a environ 1028 / 0,7% / 1,92≈76488 personnes malades, juste la plupart d'entre elles sont assis avec un léger "SRAS" à la maison et ne brillent pas.

En général, on peut le croire, le Hubei a pu obtenir 50 km en un mois et demi, l'Italie pourrait également le faire.

Il est vrai que de très grandes questions demeurent sur la même compréhension des mots «cas difficiles» en Italie et en Corée du Sud.

Il y a encore de la subtilité, mais peu importante.

Les Italiens qui meurent naturellement avec le virus comptent comme des décès par coronavirus, quelle que soit la cause réelle du décès. En tout cas, des connaissances de là m'ont écrit comme ça.
Je n'ai aucune information sur la Corée.

Traitement


En Italie, le nombre de lits d'hôpital par personne est 4 fois inférieur à celui de la Corée [12].

De toute évidence, cela conduit également au fait qu'une grande partie des cas graves sont traités «à domicile».

Il est également prouvé que les patients ayant une faible probabilité de survie n'ont tout simplement pas assez de lits et d'équipement [13, 14, 15].

Mais le manque d'hôpitaux dans le sens ne devrait affecter que les cas aigus, car il n'y a pas de remède contre le virus lui-même ni de méthode médicamenteuse pour éviter la pneumonie.

Les cas aigus représentent environ 20% de toutes les infections, y compris les infections asymptomatiques [16].

Si soudain des médecins, des lits, des ventilateurs, etc. ne manquant que pour un quart des cas graves, cela suffira à expliquer toute la mortalité en Italie.

Je n'ai pas pu trouver de données exactes à ce sujet.

Souches


Le virus mute assez rapidement. L'estimation actuelle est d'environ 30 remplacements par an. Les souches en Italie et en Corée sont vraiment un peu différentes [17]. Certes, ils diffèrent en quelques remplacements.

Ils écrivent que dans toute la variété de mutations que le virus a rencontrées, deux sous-groupes se distinguent: les soi-disant "S" et "L" par la désignation de l'acide aminé qui a été remplacé. Tout a commencé avec la version «S» [18], mais en Chine, il existe déjà 70% de la version «L». De plus, parmi les génomes lus disponibles, le remplacement S => L a été remarqué 6 fois dans des branches virales complètement indépendantes.

Ils écrivent que la version L est plus "diabolique". Mais à en juger par [17] les génomes lus d'Italie sont des S-ki «ordinaires».


Variétés italiennes vs versions coréennes


S et L du virus et de leur territoire


Variété de virus par pays. L'axe X est la date, l'axe Y est le nombre de mutations, la couleur est le pays.

Courses et mauvaises habitudes


Je n'ai vu aucun signe d'une relation entre les problèmes de virus et les races. Mais les mauvaises habitudes comme le tabagisme devraient influencer. Le virus pénètre dans la cellule en raison de la protéine ACE2, qui se trouve davantage dans les poumons du fumeur. Et le fumeur respire pire. Cependant, plus de personnes fument en Corée qu'en Italie: 2072 cigarettes par personne et par an contre 1442.

Que faire


Qui sait? Apparemment, la partie la plus importante du «traitement» du coronavirus est la prévention d'une transition vers un état grave.

En général, je recommande les vidéos d'un biologiste de système bien connu du Canada à ce sujet:


Je connais personnellement une personne qui la connaît personnellement et la loue. Les informations devraient donc être normales.

Références


  1. Statistiques sur les infections
  2. Répartition de la mortalité par âge
  3. ,
  4. 100,000
  5. , ,
  6. Johns Hopkins Medicine
  7. S L
  8. S L


Si vous avez une grande proportion de la population âgée de 60 ans et peu de lits d'hôpital, de ventilateurs, etc. gratuits, alors si le virus se propage, ce sera très, très douloureux. Un peu comme l'Italie.

PS Le génome du virus


Le génome du coronavirus COVID-19 - prend environ 7500 octets. Faible d'écrire un virus avec une taille binaire <7,5 Ko, qui affectera plus de 100 000 ordinateurs? [20]

D'accord, plaisantant.

Le virus ILOVEYOU en était très proche. Il y a sûrement des "gagnants".

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