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Mi tablero y análisis de la dinámica de la propagación de la infección por COVID-19



Quiero compartir mi tablero y análisis de la dinámica de la propagación de la infección. El tablero está escrito en Hojas de cálculo de Google y Script de aplicaciones de Google.

Minuto de atención ovni


COVID-19 — , SARS-CoV-2 (2019-nCoV). — , /, .



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Nota: El autor no pretende ser datos objetivos. Hay muchos factores directos e indirectos que afectan la fiabilidad de las estadísticas actuales. Al final de la pandemia, se realizarán investigaciones profesionales y metaanálisis que permitirán una evaluación objetiva de la pandemia en números. Este artículo fue publicado con el fin de familiarizarnos con una herramienta para analizar la dinámica de la propagación de la infección en base a los datos publicados por la OMS en sus informes.

Los paneles están disponibles en esta dirección . Los datos se actualizan automáticamente diariamente a medida que se publican los informes de la OMS. El contenido no se adapta para dispositivos móviles. Mejor ver en la pantalla grande.

Para qué


  • , , . , COVID-19;
  • . , . , , . ;
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  • Es conveniente abrir la computadora portátil por la mañana y en una pantalla para averiguar qué sucedió el día anterior.
  • Esta es una gran oportunidad para practicar con Google Sheets y Google Apps Script.


Datos


Inicialmente, utilicé los datos de los informes de la OMS , pero cometieron errores al transferir datos de los informes a la base de datos o cambiaron el tiempo en relación con el cual se consideraron las nuevas infecciones. Como resultado, reescribí los scripts para usar datos del ECDC . Estos son los mismos datos de la OMS, pero con un tiempo de publicación estable y sin errores.

Que mirar




  • Informadores Muestran la dinámica clave actual en todo el mundo;
  • La dinámica del número total de casos de infección en el mundo (TOTAL CASES);
  • La dinámica de las nuevas infecciones en todo el mundo (CASOS DIARIOS NUEVOS);
  • La dinámica de la propagación de infecciones y muertes por país;
  • Evaluar visualmente la situación en el mapa mundial;
  • Dinámica de mortalidad (CFR);
  • La duración del período pico de la epidemia por país;
  • Correlación del amplio índice S&P 500 con el número de nuevas infecciones;
  • Descubra qué tan crítica es la situación en un país en particular, ajustada para la población de ese país.


Mortalidad (CFR)




Hay mucho debate en Internet sobre la letalidad del nuevo coronavirus, hay artículos sobre Habré. No quiero entrar en otra controversia, solo opero con los datos que tenemos.

Sí, definitivamente hay problemas con la recopilación de estadísticas, hay problemas en las pruebas masivas, lo que permitiría juzgar con mayor precisión la mortalidad. La precisión de los datos también se ve afectada por factores como la epidemia de influenza estacional en Europa, la alta mortalidad en general en algunos países, como India, que, posiblemente combinada con problemas de infraestructura de salud, simplemente erosiona las estadísticas de mortalidad del nuevo coronavirus. Admito que en países con una gran cantidad de infecciones, debido a la carga en el sistema de salud, es simplemente imposible determinar la causa de la muerte de manera oportuna o, por el contrario, atribuirla a un nuevo virus. Pero, definitivamente puedes decir con certeza que muchos subestimaron la crítica de la situación.

Las personas confunden mortalidad con mortalidad . Según quien y Tasa de mortalidad de los CDC por influenza estacional - 0.1% , coronavirus SARS-CoV-2 - 4.45% al momento de la redacción (26.03.2020). En algunos países, como Italia, la mortalidad alcanza el 9% en este momento.

Sí, la letalidad del nuevo coronavirus no es tan alta como la del MERS-CoV y el Ébola (34% y 50%), pero la contagio , la virulencia , la velocidad y el grado de propagación del nuevo coronavirus no se pueden comparar, son mucho más altos.

Período pico


Para trabajar, necesitaba saber cuánto dura el período pico de la epidemia en un país en particular. Si tenemos en cuenta que la mayoría de los países tomarán medidas más o menos proporcionales de la cuarentena total, en función de la experiencia de otros países, podemos juzgar cuándo disminuirá la epidemia en un país en particular.

No encontré ninguna metodología para determinar el período pico, así que tuve que improvisar. Con base en la dinámica en términos del número de nuevas infecciones, decidí determinar la importancia de las nuevas infecciones sobre la base de las cuales sería posible juzgar si el pico de la epidemia ha pasado o si el país está en un período pico. El promedio y la mediana no encajaban bastante, así que decidí usar Quartile. Eliminé días con un valor cero de una muestra de datos sobre nuevas infecciones, después de esta normalización, usé la función para determinar el valor del Tercer Cuartil. Además, la fórmula considera el número de días que exceden el valor del Tercer Cuartil; esta es la duración del período pico.

Si aplica este cálculo para todos los países, puede usarse para comparar el período pico de los países.

El período pico reflejará de manera más confiable la situación hacia el final de la epidemia. Puede ver los plazos de China y Corea del Sur, donde ha pasado el pico máximo de la epidemia. A pesar del hecho de que todavía hay nuevas infecciones en China y Corea del Sur, el cálculo del período pico refleja perfectamente la efectividad de los notorios métodos de cuarentena total y métodos de suavizado de curvas adoptados en Corea del Sur. Tenga en cuenta que existe el riesgo de una segunda ola de la epidemia en el sur de Asia. Debido a la eliminación apresurada de la cuarentena, o debido a la importación del virus de los países vecinos, donde la epidemia apenas está comenzando. Por lo tanto, el período pico puede aumentar.

Tabla de resumen del país


Muestra toda la información clave por país, y también hay plazos para evaluar visualmente la curva epidémica.



Datos del mapa mundial


La visualización en el mapa le permite evaluar los focos actuales de infección.



Lo que planeo agregar


  • Tablas separadas sobre el número de infecciones ajustadas para la población ;
  • Visualización de dinámicas en mapas mundiales ajustados por población ;
  • Destaque visualmente los períodos pico si una epidemia en un país en particular se encuentra actualmente en un período pico.


Retroalimentación


Estaré encantado de escuchar sus deseos y recomendaciones para que el Tablero sea aún más informativo.

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