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Coronavirus: filogenia, tabaquismo, mortalidad y reducción del riesgo de enfermarse



Existe la sensación de que sobre la epidemia COVID-19 ahora se transmite desde cada hierro. En este sentido, Habr complace con buenas publicaciones con fuentes normales y una discusión constructiva. También decidí compartir nuevas preimpresiones sobre la expresión de ACE2 en ratones fumados, las características de la genética y la evolución del virus, así como recomendaciones para reducir el riesgo de enfermarse. Y como estamos haciendo el cuidado de los ojos en el laboratorio, acabo de recibir preguntas que ayudan. En resumen, un paquete en la cabeza ayuda mejor.

Minuto de atención ovni


La pandemia COVID-19, una infección respiratoria aguda potencialmente grave causada por el coronavirus SARS-CoV-2 (2019-nCoV), se ha anunciado oficialmente en el mundo. Hay mucha información sobre Habré sobre este tema; recuerde siempre que puede ser confiable / útil, y viceversa.



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Evolution complete!


Todas las poblaciones de organismos vivos evolucionan. No muy animado tampoco, si existe la presión de la selección natural y la capacidad de mutar. Los virus tradicionalmente ocupan una especie de nicho intermedio entre los vivos y los no vivos debido a su primitividad e incapacidad para reproducirse independientemente. De hecho, esta es una forma de vida extremadamente minimalista (aunque discuten al respecto), que ha ahorrado en todo lo que es posible. No hay síntesis de proteínas, no hay replicación autónoma de información genética. Solo un pequeño bulto de proteínas protectoras, mecanismos proteicos para la penetración en la célula huésped y algo de ADN / ARN.

Además, los virus tienen otra característica importante que les permite evolucionar órdenes de magnitud más rápido que otras especies. Todo está mal con los mecanismos de reparación, que se pueden comparar con los sistemas de control de paridad en TI. Por lo tanto, la mayoría de las veces no quedan impresionados si se cae un fragmento de código no muy necesario durante el proceso de reproducción o, por el contrario, se captura un fragmento de ADN del huésped. Los virus se multiplican en cantidades tales que un cierto porcentaje de viriones defectuosos generalmente no afecta la capacidad de reproducción.

Hay que decir que esta inestabilidad de la estructura genética tiene ventajas y desventajas para nosotros. Por un lado, aumenta los riesgos de eludir nuestra inmunidad, que, al buscar linfocitos B, recogió una combinación exitosa de anticuerpos para suprimir la variante del virus anterior. Por lo tanto, el cambio en la neuraminidasa y la hemaglutinina, que HxNy en la designación de cepas de influenza, hace que los anticuerpos pasados ​​sean inútiles. Por otro lado, las mutaciones frecuentes en combinación con medidas de cuarentena conducen a la selección de cepas en una forma más ligera.

Por ejemplo, si el virus 24 horas después de la infección hace que la sangre fluya desde los oídos y tenga una alta tasa de mortalidad, lo más probable es que no pueda reproducirse rápidamente debido a su visibilidad, el trabajo de los médicos de cuarentena y las personas duras con lanzallamas. Al mismo tiempo, los mutantes, que en lugar de síntomas terribles se limitan a los mocos y estornudos continuos, tienen muchas más posibilidades de reproducción, ya que no intentarán encerrar a esas personas en zonas protegidas de cuarentena.

En el caso de COVID-19, los médicos están tratando de detectar cualquier forma visible lo más rápido posible, incluida la selección hacia el curso leve de la enfermedad. Si ha tenido una forma leve y asintomática de coronavirus, lo más probable es que una variedad severa no pueda infectarlo. Sí, estoy al tanto de los informes de reinfección de SARS-CoV-2. Pero probablemente hay varias opciones. En primer lugar, pueden ser falsas pruebas negativas, que inicialmente mostraron recuperación, y luego nuevamente dieron un resultado positivo. En segundo lugar, hay un cierto porcentaje de pacientes que no forman una inmunidad prolongada intensa. Solo pueden confiar en la inmunidad del rebaño: la inmunidad de la multitud.


Árbol filogenético SARS-CoV-2. En el eje horizontal, el número de nucleótidos diferentes. Fuente

Si hablamos de la filogenia del SARS-CoV-2, entonces no difiere en la susceptibilidad a la mutación. Actualmente hay 48 variantes registradas de este virus, y la rama naranja más lejana de Wuhan-Hu-1/2019, la rama naranja, tiene solo 12 nucleótidos distintos. Esta es una muestra registrada en Finlandia con un antepasado italiano.

Aparentemente, la selección hacia formas más ligeras puede durar muchos años si la pandemia no puede ser aplastada.

Pasando a consejos: fumar es malo, pero es demasiado tarde para sacudir el bote


Como ya se sabe, el virus utiliza el receptor de membrana para la proteína ACE2 (enzima convertidora de angiotensina) para la fijación y la entrada inicial a la célula huésped. Muy a menudo, estos receptores se encuentran en el epitelio del tracto respiratorio y se expresan en algunas cantidades por las células epiteliales de la cavidad oral. Cuanto más se expresa ACE2, más fácil es que el virus infecte inicialmente el cuerpo y se multiplique durante el curso de la enfermedad. Hay varios factores

En primer lugar, debes ser "afortunado" con el genotipo. Esta proteína está codificada por dos variantes de los genes I y D. En consecuencia, son posibles combinaciones de II, ID, DD. Si tiene DD, además de los altos riesgos en términos de enfermedad cardiovascular, tiene una vulnerabilidad adicional al SARS-CoV-2. En consecuencia, la mortalidad en diferentes poblaciones de la humanidad puede diferir debido a diferencias en la proporción de genotipos.

En segundo lugar, dejar de fumar. No, esto no lo ayudará con la pandemia actual, pero en cualquier caso, este es un factor agravante. Encontré una preimpresión interesante que indica un aumento en la expresión de ACE2 en los fumadores.


Niveles de expresión de ACE2 relativos en voluntarios con antecedentes de tabaquismo diferentes. GSE994 - expresión en los pulmones, GSE17913 - expresión en la cavidad oral.

Los estudios han demostrado que la expresión es significativamente mayor en los fumadores en comparación con aquellos que nunca han fumado o dejado de fumar. Desafortunadamente, el estudio no indicó cuánto tiempo los antiguos voluntarios dejaron de fumar, pero lo más probable es que sean más de 10 años.
La puerta de entrada principal para la infección suele ser ligera, pero con una mayor expresión en la cavidad oral, existe un mayor riesgo de recibir una dosis vital del virus simplemente lamiéndose los dedos después del metro.


Expresión de ACE2 en ratones fumadores.

Se obtuvieron resultados similares en el modelo de ratones fumadores, que se vieron obligados a respirar humo de tabaco con cierta frecuencia durante hasta cinco meses. En este caso, se observó una correlación directa entre la duración del tabaquismo en ratones y el grado de expresión.

Resumen: si usted es un fumador anciano, sus riesgos de mortalidad son extremadamente altos.

Sobre Umifenovir


Existen varias preparaciones comerciales bastante conocidas con umifenovir como sustancia activa. Se promueve bastante activamente en el mercado interno para el tratamiento de todo tipo de enfermedades virales.

En el estudio, fue comparado con placebo. Como resultado, el grupo placebo dio PCR negativa para coronavirus en el 71.8% de los casos y umifenovir en el 82.6% de los casos. Por lo tanto, las tabletas sin una sustancia activa no tuvieron diferencias estadísticamente significativas con respecto al umifenovir en términos de su efecto sobre la tasa de recuperación.

Mortalidad y experiencia humana.


Un tema que molesta a todos y causa la mayor controversia. Como se ha dicho muchas veces, es incorrecto medir la mortalidad antes del final de la epidemia, pero se puede determinar con un error u otro según los modelos de epidemia. Esta es exactamente la situación en la que el sesgo de selección aumenta a su altura máxima: los pacientes con síntomas graves no acuden al médico, sino que simplemente tosen un poco e infectan a todos los demás.


Barco de la Peste - Princesa Diamante

Para un experimento correcto, debe encerrar a una multitud de personas en un espacio limitado, esperar hasta que todos se enfermen y contar la cantidad de sobrevivientes. Por supuesto, tales métodos no son muy humanos, pero tal experimento resultó por accidente en el incidente con Diamond Princess, cuando 3.600 personas fueron puestas en cuarentena. Como resultado, a pesar de las precauciones y el traslado regular de los infectados al hospital, más y más nuevos pasajeros y personal se infectaron. El resultado fue una buena estimación del límite inferior de mortalidad: 1%. Dado que los pasajeros del crucero eran en su mayoría ancianos, se puede suponer que en la población general la tasa de mortalidad será de al menos 0.4-0.5%. El número reproductivo básico es R0, en el caso del revestimiento es 2.8, que es comparable a la gripe. Se debería notarque este coeficiente es aplicable a condiciones de cuarentena duras. En una ciudad grande sin eventos especiales, puede ser significativamente mayor.
El límite superior ahora se estima en alrededor del 4%. El principal grupo de riesgo son los pacientes de edad avanzada ( fuente , datos al 17 de febrero):

Años



Mortalidad



Más de 80 años



14,8%



70-79 años de edad



8.0%



60-69 años de edad



3,6%



50-59 años de edad



1.3%



40-49 años de edad



0.4%



30-39 años de edad



0.2%



20-29 años de edad



0.2%



10-19 años de edad



0.2%



0-9 años de edad



0 0



No te lamas las manos



El mayor problema para propagar el virus son las manos. Si recuerda, las puertas de entrada son las células de la cavidad oral y el tracto pulmonar que expresan ACE2.

Los respiradores de clase FFP3 / N99 brindan cierta protección contra el aerosol viral. Además, es muy desafortunado meterse bajo una nube de partículas virales en gotas de saliva y moco después de una persona estornudada. En promedio, una nube de este tipo en el interior cuelga en el aire durante no más de cinco minutos, después de lo cual se deposita en los objetos circundantes. Es bastante divertido cuando el paciente tose o estornuda en la palma de la mano, después de lo cual toca todos los pasamanos y manijas en una fila. Por lo tanto, la recomendación banal de procesar regularmente las manijas de las puertas y lavarse las manos constantemente es más que efectiva, siempre que no se encuentre cerca de personas que estornudan.

Las mascarillas y los respiradores, por cierto, tienen otro efecto importante: no te permiten tocarte los labios y la nariz con las manos infectadas.


Hay una hermosa serie de Legionbreakers dedicados a la contaminación. Muestra muy claramente cómo el Adán "infectado" cubre rápidamente con un marcador ultravioleta todo alrededor, incluidas las caras de sus colegas.


Hombres, deshágase del deseo irresistible de tocarse mutuamente la mano.

En resumen, láveme las manos, limpie el teclado con el mouse con alcohol y destelle la manera de saludar. Muchas veces vi este extraño ritual en espacios abiertos, cuando una multitud de personas pasa cinco minutos para tocarse. Naturalmente, nadie se lava las manos después del metro.

¿Qué debe hacer si protegió relativamente sus pulmones de un aerosol viral con un respirador, pero en el metro tosió sospechosamente a un sospechoso italiano con raíces asiáticas hablando por teléfono en farsi? Para empezar, no es necesario envolverse en una sábana blanca e inmediatamente gatear hacia el cementerio. Pero esto tampoco significa que deba caminar todo el día cubierto de gotas de saliva y mucosidad extraterrestre de la nasofaringe. Sí, no inhalaste el aerosol viral, pero algunas partículas entraron en las membranas mucosas de los ojos. Las membranas mucosas de los ojos, al parecer, no son la puerta de entrada a la infección, pero los canales nasolagrimales eliminan todo hacia la nasofaringe, donde el virus puede eventualmente repararse. De hecho, en ausencia de gafas selladas, los ojos se convierten en una puerta de entrada adicional para la infección.

Tiene varias formas de resolver el problema: si fue tosido justo en la entrada de su casa, será óptimo lavarse bien y lavarse bien los ojos. Para el lavado, nuestro laboratorio tiene una blefarolotión . La primera parte de las preguntas que me hicieron es sobre él. No, incluso si limpia los párpados de acuerdo con las instrucciones, esto no ayudará con el virus. Más precisamente, ayudará de la misma manera que se lava con agua. Pero blepharolotion se desarrolló para los párpados, por lo que cuando se lava menos daña estos mismos párpados. Es mejor lavar con equipo especial y caminar limpio que no lavar en absoluto. Pero es mejor lavarse con agua que ensuciarse.

Peor aún, si no hay forma de lavarse completamente con jabón. Lo más importante: no vierta desinfectantes agresivos en sus ojos, obtendrá una quemadura química. Casi todos los protocolos médicos para el contacto con fluidos biológicamente contaminados en los ojos implican el lavado con soluciones neutras. La córnea es una estructura extremadamente delicada y se daña de manera irreversible con medicamentos inadecuados. En el caso de procesamiento con elementos neutros, parte de los viriones se eliminarán de la superficie. Un poco más tarde, lávate los ojos por completo cuando encuentres el lavabo. También es conveniente usar blepharosafe estérilHemos desarrollado para tratar la piel alrededor de los ojos. Los hicimos para reanimación y para otra, pero al final están en casi todas las farmacias en paquetes individuales "para limpiar los ojos" (en realidad un siglo). Funciona muy bien. No, ella no está luchando contra el maquillaje. No, el virus no destruye, pero le permite reducir ligeramente los riesgos. Como el agua.



Por lo tanto, el principio general es que se necesita protección para los ojos, ya sea completamente (un traje espacial), o lavarse a tiempo, o no caminar en lugares públicos donde puedan estornudar en la cara. A juzgar por la conclusión de los epidemiólogos chinos , una distancia de al menos 4,5 metros puede considerarse segura. No irá a ninguna parte del metro, pero ya hay personas especiales paradas allí que miden la temperatura con una cámara termográfica, por lo que, lógicamente, todo debería ser relativamente bueno.

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